Το Δ.Π.Μ.Σ. «Εφαρμοσμένη Γεωπληροφορική» αποτελεί συνέχεια της επί 17 χρόνια επιτυχημένης λειτουργίας Μεταπτυχιακής Κατεύθυνσης με συναφές αντικείμενο (Γεωπληροφορική) στα πλαίσια του Π.Μ.Σ. του Τμήματος Γεωγραφίας του Χαροκόπειου Πανεπιστημίου με τίτλο «Εφαρμοσμένη Γεωγραφία και Διαχείριση του Χώρου». Η κατεύθυνση αυτή αποτέλεσε για 17 έτη μια βασική επιλογή για ποιοτικές μεταπτυχιακές σπουδές στο αντικείμενο στον ελληνικό χώρο και συγκέντρωσε το ενδιαφέρον περισσότερων από 800 νέων επιστημόνων, 170 εκ των οποίων την παρακολούθησαν με επιτυχία αφού είχαν ολοκληρώσει το πρώτο κύκλο σπουδών σε συγγενή επιστημονικά πεδία (Γεωγραφία, Γεωλογία, Γεωπονία-Δασολογία, Τοπογραφία, Χωροταξία, Περιβάλλον, Αρχιτεκτονική, Πληροφορική, κλπ).
Ως προς τη φυσιογνωμία και δομή του, το Δ.Π.Μ.Σ. «Εφαρμοσμένη Γεωπληροφορική» συνδυάζει αντικείμενα καταγραφής και αναπαράστασης, ανάλυσης και σχεδιασμού του χώρου (Τηλεπισκόπηση, GIS κ.λπ.), και αντικείμενα / τεχνολογίες αιχμής που σχετίζονται με τα παραπάνω, όπως χωρικές βάσεις δεδομένων, οπτικοποίηση, μέθοδοι και συστήματα αναπαράστασης γνώσης, έμπειρα συστήματα, τηλεματική, τεχνητή νοημοσύνη, κ.λπ.
Ειδικότερα ερευνητικά αντικείμενα αποτελούν η μοντελοποίηση φυσικών διεργασιών και καταστροφών, η παρακολούθηση του φυσικού και του ανθρωπογενούς περιβάλλοντος, η εφαρμοσμένη χωρική ανάλυση, και η διαχείριση γεωχωρικών δεδομένων μεγάλου όγκου.